普通門診樓、病房樓對室內溫濕度、空氣品質要求較高。制冷機組常用螺桿式水冷冷水機組，熱源常采用燃氣鍋爐。主機系統也可以采用水源熱泵機組，一機兩用。因病人較脆弱，對溫度比較敏感，故病房樓的空調時間較普通建筑更長，過度季節通常會開啟空調系統。同時因醫院人員較多、各類藥品氣味較重，故新風系統是必須要設計的。因新風量較大、新風機組使用時間長、室內對空氣品質要求較高，故其新風機組常使用熱回收式潔凈新風機組。